Инженер Майкл сознательно идёт на ограбление банка, чтобы попасть в тюрьму Фокс-Ривер, где его брат Линкольн ждёт казни за убийство Стедмана, брата вице-президента США. Майкл уверен, что обвинение сфабриковано, и превращает тюремную камеру в часть тщательно продуманного плана: рисунки на его теле скрывают подсказки к побегу. Пока он ищет нужные детали и проверяет Сукре, Вероника пытается разобрать видеозапись, которая будто бы подтверждает вину Линкольна. Внутри тюрьмы Майклу приходится считаться с Белликом, Бэгом и опасными правилами местной иерархии.

Майкл собирает вокруг себя Сукре, Абруцци и Бэга для побега
Линкольн ждёт исполнения приговора и пытается понять, кто его подставил
Вероника ищет доказательства заговора вокруг гибели Стедмана
Беллик и надзиратели Фокс-Ривера давят на Майкла и его союзников

Этот сезон держится на столкновении двух миров: Майкл просчитывает каждый шаг внутри Фокс-Ривера, а Вероника снаружи разбирается с политическим давлением и исчезающими уликами. Тюремная история постепенно расширяется: к плану подключаются люди с разными мотивами, старые конфликты вспыхивают из-за одной детали, а любая ошибка грозит Майклу и Линкольну расправой. По тону это жёсткий триллер с редкими передышками, чёрным юмором и упором на наблюдательность. Побег здесь не один рывок, а цепь рискованных решений, где доверие приходится заслуживать заново.